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這真的很酷(而且很瘋狂):
科學家們首次模擬了一個完整的活細胞。每一個分子,每一個反應,從 DNA 複製到細胞分裂。
這篇論文(Luthey-Schulten et al., Cell 2026),今天剛剛發表,使用了 JCVI-Syn3A——一種基因少於 500 的合成最小細菌。對完整的 105 分鐘細胞週期進行 3D+時間模擬:DNA 複製、蛋白質翻譯、新陳代謝、分裂。每一個基因、蛋白質、RNA 和化學反應都在物理空間中被追蹤。
這花了幾年時間來建造。多個 GPU。每次運行需要六天的計算時間。
而這是最簡單的細胞。
一個人類細胞大約有 20,000 個基因。它生活在組織中。它與鄰近細胞互動。它會分化。它對藥物的反應取決於我們尚未完全測量的上下文。
對最小細胞的機械模擬需要 6 GPU 天來模擬 105 分鐘的生物學。你無法將其擴展到人類細胞。其複雜性並不是 40 倍更難,而是指數級更難。
這就是為什麼這個領域轉向數據驅動模型的原因。你無法手動編碼人類肝細胞的調控連接。但如果你擁有足夠多樣的生物上下文中收集的正確擾動數據,你可以學習它。
這兩種方法並不是競爭關係。像這樣的論文生成了未來機器學習模型所需的基準真相以進行驗證。但通往臨床有用的虛擬細胞的道路是通過基礎模型,而不是通過擴大機械模擬。
驚人的工作!
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